После грязелечения быстрее происходи сращивание костей в местах переломов и т. п. После Крымской войны (1853—1856) сакской грязью лечили раненых участников героической обороны Севастополя.
Вскоре после разгрома Красной Армией врангелевских войск в Крыму, летом 1921 г., в Саках было открыто отделение Военно-курортной станции, которое позднее переименовали в Сакский санаторий РККА (Рабоче-Крестьянской Красной Армии). Основным назначением здравницы было лечение раненых и больных красноармейцев и командиров.

После реконструкции, проведенной в 1938 г., здравниц перешла на круглогодичную работу. В том же году санатория принял на лечение бойцов, раненных в боях с японцами Е районе озера Хасан, а в 1939-м — в боях под Халхин-Голом В 1940 г. сюда поступили воины, получившие ранения в войне с белофиннами. В это время лечение боевых травм грязями успешно осуществлялось в санатории под руководством профессора Д. А. Новожилова.

В августе 1941 г. санаторий был закрыт, а медицинский персонал направлен в действующую армию. В период гитлеровской оккупации были разрушены многие здания, вырублен парк. Здравнице был нанесен ущерб более чем на 3,5 миллиона рублей.

После освобождения Крыма от немецко-фашистских захватчиков, с августа 1944 г., санаторий стал принимать на лечение раненых и больных воинов. Восстановление здравницы полностью завершилось в 1950 г.

С сакским санаторием Министерства обороны связана интересная страница истории Второй мировой войны. Как известно, с 4 по И февраля 1945 г. в Ялте проходила конференция глав правительств трех союзных держав — СССР, США и Великобритании. Самолеты с делегациями союзных стран, прибывшими на конференцию, принимал сакский аэродром. Вспомогательные службы этих делегаций были размещены в корпусах военного санатория. За хорошее обслуживание участников Крымской конференции персоналу здравницы 23 февраля 1945 г. была объявлена благодарность Совнаркома СССР.

В 1962 г. после возвращения из космоса в санатории отдыхал летчик-космонавт СССР Герой Советского Союза Г. С. Титов. Здесь лечился прославленный летчик, трижды Герой Советского Союза А. И. Покрышкин.